教育科学学院成立于2018年1月，前身为牡丹江师范学院教师教育学院。目前，教育科学学院本科开设心理学、小学教育、学前教育三个专业。教育科学学院现有黑龙江省教育学实验教学示范中心；黑龙江省博士后创新创业实践基地；黑龙江省基础教育信息技术研究团队、黑龙江省基础教育教师专业发展团队；教育硕士教学团队获批黑龙江优秀研究生导学团队。2014年1月，获得教育硕士专业学位授予权，涵盖12个领域，既：教育管理、心理健康教育、小学教育、现代教育技术、数学学科教学、语文学科教学、物理学科教学、化学学科教学、生物学科教学、历史学科教学、思政学科教学、英语学科教学。（其中教育硕士在教育科学学院设有3个专业方向：教育管理、心理健康教育、小学教育）。教育硕士学科团队由12个领域140人的专兼职教师组成，其中正高职52人，副高职78人（含中学高级），讲师10人（含中学一级），具有博士学位的27人。近5年来，教育硕士教学团队主持国家社会科学基金课题4项，主持国家自然科学基金课题3项，主持教育部重点课题2项，文化部重点课题1项，教育部、黑龙江省社会科学基金课题6项，出版教材、著作55部，发表核心以上论文155篇，拥有雄厚的教育科研底蕴和实力，拥有完善的培养高级应用型教育人才所需的实验室、实训室、实践基地等一系列教学条件，是黑龙江省东部地区基础教育优秀后备人才和高级教育专家的培养培训基地。